Category Archives: hpc

Προβλέποντας την κλιματική αλλαγή στην Ευρώπη με χρήση της υπερυπολογιστικής υποδομής ARIS του ΕΔΕΤ

Τις τελευταίες δεκαετίες ο πλανήτης δοκιμάζεται από το παγκόσμιο φαινόμενο της κλιματικής αλλαγής. Η άνοδος της θερμοκρασίας σε παγκόσμιο επίπεδο αλλά και η εμφάνιση ακραίων καιρικών φαινομένων σε τοπικό επίπεδο, όπως οι παρατεταμένες ξηρασίες και οι συχνότερες πλημμύρες από ραγδαίες βροχοπτώσεις, προκαλούν σοβαρές επιπτώσεις στην ευημερία του κοινωνικού συνόλου και στην οικονομία.

ARIS High Performance Computing: η τεχνολογική λύση του ΕΔΕΤ για Κλιματικές Προσομοιώσεις υψηλής ανάλυσης

Η ομάδα της Ελένης Κατράγκου από το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης πραγματοποιεί κλιματικές προσομοιώσεις για το Ευρωπαϊκό κλίμα του 21ου αιώνα στο πλαίσιο του διεθνούς προγράμματος Coordinated Regional Downscaling Experiment (CORDEX), κάνοντας χρήση της υπερυπολογιστικής υποδομής ARIS του ΕΔΕΤ.

“H χρήση των υπερυπολογιστικών πόρων και υπηρεσιών του ΕΔΕΤ ήταν καταλυτική για την ολοκλήρωση των κλιματικών προβολών σε υψηλή χωρική κλίμακα” εξηγεί η Δρ. Κατράγκου. “H υψηλή χωρική ανάλυση στα αποτελέσματα ενός μοντέλου είναι απαραίτητη όταν πρέπει να εκτιμηθούν οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής σε τομείς όπως η Υγεία, η Γεωργία, η Βιοποικιλότητα, η Ενέργεια, ο Τουρισμός κλπ. ”

Για την παραγωγή των αποτελεσμάτων χρησιμοποιήθηκαν, 1.129.211 υπολογιστικές ώρες στo σύστημα ARIS. Η μέγιστη κλιμάκωσή της ερευνητικής εφαρμογής, δηλαδή ο μέγιστος αριθμός υπολογιστικών πυρήνων που χρησιμοποιήθηκαν ταυτόχρονα από μια διεργασία ήταν 640 πυρήνες.

Πρόσβαση στο πλήρες άρθρο

Open days 2017: το ΕΔΕΤ υποδέχεται το κοινό στις εγκαταστάσεις του υπερ-υπολογιστή ARIS

Δευτέρα, 22 Μαΐου 2017

Υπουργείο Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων

Ώρες 10.00 – 13.00

Το Εθνικό Δίκτυο Έρευνας και Τεχνολογίας ανοίγει τις πόρτες των εγκαταστάσεων του εθνικού υπερ-υπολογιστικού συστήματος ARIS, προσφέροντας στο κοινό την ευκαιρία να ανακαλύψει τις δυνατότητες μίας από τις πλέον εξελιγμένες τεχνολογικά υποδομές για την υλοποίηση επιστημονικών εφαρμογών μεγάλης κλίμακας. Οι ξεναγήσεις θα πραγματοποιηθούν στις 22 Μαΐου 2017 και ώρες 10.00 – 13.00, στο Υπουργείο Παιδείας Έρευνας και Θρησκευμάτων, Ανδρέα Παπανδρέου 37, Μαρούσι.

https://goo.gl/maps/JWHMr47WgR12

Εξειδικευμένα στελέχη του ΕΔΕΤ θα υποδεχθούν τους επισκέπτες σε ομάδες των 15 ατόμων, και θα τηρηθεί σειρά προτεραιότητας.

Οι ενδιαφερόμενοι μπορούν να δηλώσουν τη συμμετοχή τους στις ξεναγήσεις με online εγγραφή από τη σελίδα: https://hpc.grnet.gr/news-events/opendays2017/

Η πρωτοβουλία λαμβάνει χώρα στο πλαίσιο των ανοικτών εκδηλώσεων “Οpen days 2017” της Πανευρωπαϊκής καμπάνιας “Europe in my region 2017” που στόχο έχει να δώσει την ευκαιρία στους πολίτες να ανακαλύψουν τα αποτελέσματα και να μάθουν περισσότερα σχετικά με τα συγχρηματοδοτούμενα ευρωπαϊκά προγράμματα και τη σημασία τους σε τοπικό επίπεδο.

Το ΕΔΕΤ έθεσε σε λειτουργία τον υπερυπολογιστή ΑRIS τον Ιούλιο του 2015, προσφέροντας ένα ισχυρό εργαλείο έρευνας στους επιστήμονες της χώρας. Στους πρώτους μήνες λειτουργίας, συμπεριελήφθη στη λίστα με τους 500 ισχυρότερους υπολογιστές του κόσμου (top500.org) βάζοντας την Ελλάδα στον παγκόσμιο χάρτη των συστημάτων υψηλών επιδόσεων. Σήμερα αποτελεί μέρος του Ευρωπαϊκού οικοσυστήματος υπερυπολογιστών PRACE.

Η προμήθεια και εγκατάσταση του συστήματος υλοποιήθηκε στο πλαίσιο του έργου «PRACE-GR – Ανάπτυξη Εθνικής Υπερυπολογιστικής Υποδομής και Παροχής Συναφών Υπηρεσιών στην Ελληνική Ερευνητική και Ακαδημαϊκή Κοινότητα», με συγχρηματοδότηση του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Αττική», Άξονας Προτεραιότητας «03 – Ενίσχυση της Ανταγωνιστικότητας της Καινοτομίας και της Ψηφιακής Σύγκλισης» και το Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ).

Χρήσιμοι σύνδεσμοι:

Πρόσβαση Ελληνικών Τεχνολογικών Επιχειρήσεων στο Εθνικό Υπερ-υπολογιστικό Σύστημα ARIS

Με στόχο την προώθηση της έρευνας και καινοτομίας με την αξιοποίηση υπολογιστικών συστημάτων υψηλών επιδόσεων, το Εθνικό Δίκτυο Έρευνας και Τεχνολογίας (ΕΔΕΤ) θα παράσχει σε Ελληνικές Τεχνολογικές Επιχειρήσεις πρόσβαση στο εθνικό υπερ-υπολογιστικό σύστημα ARIS. Η πρόσκληση αφορά σε κοινές προτάσεις επιχειρήσεων με ερευνητικές ομάδες των δημόσιων Ακαδημαϊκών / Ερευνητικών Ιδρυμάτων για έργα που στηρίζονται σε υπολογιστικά συστήματα υψηλών επιδόσεων. Η μέγιστη χρονική διάρκεια πρόσβασης στο σύστημα είναι έξι μήνες.

Οι όροι συμμετοχής και η διαδικασία αξιολόγησης είναι διαθέσιμα στην ιστοσελίδα της υπηρεσίας HPC του ΕΔΕΤ στο σύνδεσμο:
https://hpc.grnet.gr/calls/industry-sme-pilot-call-1

Οι ενδιαφερόμενοι μπορούν να υποβάλλουν τις προτάσεις τους έως την Παρασκευή 3 Μαρτίου 2017, και ώρα 18:00.

Το ΕΔΕΤ στοχεύει στην ενίσχυση της ανταγωνιστικής ερευνητικής δραστηριότητας των ελληνικών επιχειρήσεων, διαθέτοντας για πρώτη φορά υπερυπολογιστικές υποδομές και εργαλεία για την υλοποίηση έργων υψηλών τεχνολογικών προδιαγραφών.

Προσκλήσεις για project access PRACE Tier-0 και Tier-1

Ανακοινώθηκαν από τον οργανισμό PRACE  δύο ανοιχτές προσκλήσεις:

To PRACE Project Access αφορά σε έργα με μεγάλη δυνατότητα κλιμάκωσης (scalability) και πολύ μεγάλες ανάγκες για υπολογιστικό χρόνο, που ξεπερνούν τις δυνατότητες του Εθνικού συστήματος ARIS. Η καταληκτική ημερομηνία υποβολής των προτάσεων για πρόσβαση στα συστήματα Tier-0 είναι η 21η Νοεμβρίου 2016 και ώρα 10:00 CET.

Επισκεφθείτε την ιστοσελίδα του PRACE Project Access για περισσότερες πληροφορίες σχετικά με την πρόσκληση.

To Call for Proposals for DECI-14 (Tier-1) έχει σχεδιαστεί για έργα που απαιτούν πρόσβαση σε υπολογιστικούς πόρους που επί του παρόντος δεν διατίθενται στη χώρα του ερευνητή, ενώ ταυτόχρονα δεν απαιτούν τα μεγαλύτερα συστήματα της Ευρωπαϊκή υπερ-υπολογιστικής υποδομής Tier-0. Η καταληκτική ημερομηνία υποβολής των προτάσεων για πρόσβαση στα συστήματα Tier-1 (DECI-14) είναι η 21η Νοεμβρίου 2016, στις 17:00 CET.

Περισσότερες πληροφορίες σχετικά με την πρόσκληση και τα διαθέσιμα συστήματα μπορείτε να βρείτε στην ιστοσελίδα του PRACE DECI-14.

GRNET HPC: 3η Πρόσκληση Υποβολής Προτάσεων Έργων Παραγωγής για πρόσβαση στο εθνικό υπέρ-υπολογιστικό σύστημα ARIS

Το ΕΔΕΤ προσκαλεί επιστήμονες και ερευνητές  που εργάζονται σε Ελληνικά εκπαιδευτικά ή/και ερευνητικά ιδρύματα να υποβάλλουν προτάσεις έργων παραγωγής για πρόσβαση στο εθνικό υπέρ-υπολογιστικό σύστημα ARIS. Η πρόσβαση θα αποδοθεί για περίοδο 12 μηνών, ξεκινώντας από την ημερομηνία αποδοχής του έργου. Οι προτάσεις έργων θα πρέπει να αφορούν σε ανοιχτή έρευνα, ανεξαρτήτως επιστημονικού πεδίου.

Η υποδομή ARIS αποτελείται από συνολικά τέσσερις νησίδες υπολογιστικών συστημάτων βασισμένων σε αρχιτεκτονική Intel x86, διασυνδεμένων σε ένα ενιαίο δίκτυο Infiniband FDR14, που προσφέρουν πολλαπλές δυνατότητες και αρχιτεκτονικές επεξεργασίας.

Μέσω της πρόσκλησης, το ΕΔΕΤ καθιστά δυνατή την πλήρη και ισότιμη πρόσβαση στο εθνικό υπέρ-υπολογιστικό σύστημα ARIS, για όλους τους επιστήμονες που εργάζονται σε Ελληνικά ιδρύματα.

Δείτε το πλήρες κείμενο της τρίτης πρόσκλησης για πληροφορίες σχετικές με τους στόχους και τα κριτήρια επιλογής, την επιλεξιμότητα, το υπολογιστικό σύστημα HPC – ARIS, τους διαθέσιμους πόρους, τη διαδικασία αίτησης και τις καταληκτικές ημερομηνίες.

Επικοινωνία: hpc-access  at  lists.grnet.gr

 

GRNET HPC:  Τι αλλάζει στην αξιολόγηση προτάσεων για έργα προετοιμασίας / ανάπτυξης,  στον εξοπλισμό του συστήματος και στην κατανομή πόρων

Από την 1η Σεπτεμβρίου 2016 η αξιολόγηση των προτάσεων για έργα προετοιμασίας / ανάπτυξης στο σύστημα ARIS πραγματοποιείται σε συνεχή βάση και οι ερευνητές θα λαμβάνουν τα αποτελέσματα της αίτησης τους εντός 10 εργάσιμων ημερών από τη σχετική ημερομηνία υποβολής.

Το σύστημα ARIS έχει επεκταθεί με τους παρακάτω τύπους υπολογιστικού εξοπλισμού:

  • νησίδα κόμβων μεγάλης μνήμης (fat node island) που αποτελείται από 44 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R820. Κάθε εξυπηρετητής προσφέρει 4 επεξεργαστές Intel Xeon E5-4650v2 και 512 GB κεντρικής μνήμης
  • νησίδα κόμβων GPU (GPU island)  που αποτελείται από 44 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R730. Κάθε εξυπηρετητής περιέχει 2 επεξεργαστές Intel Xeon E5-2660v3, 64 GB μνήμης και 2 κάρτες GPU NVidia K40, και
  • νησίδα κόμβων Xeon Phi (Xeon Phi Island) που αποτελείται από 18 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R730, καθένας εκ των οποίων περιέχει 2 επεξεργαστές Intel Xeon E5-2660v3, 64 GB μνήμης και 2 συνεπεξεργαστές Intel Xeon Phi 7120P

Έτσι, ανανεώθηκαν τα όρια στην κατανομή πόρων σε έργα προετοιμασίας ή ανάπτυξης, για κάθε νησίδα, και ο μέγιστος αριθμός core hours που παρέχονται είναι:

  • 100.000 core hours στο Thin Node island (προ- υπάρχων σύστημα),
  • 50.000 core hours στο GPU island,
  • 50.000 core hours στο Xeon Phi island,
  • και 100.000 core hours στο Fat Node island.

O συνολικός αριθμός core hours που μπορεί να ζητηθεί δεν πρέπει να ξεπερνάει τις 100.000. Σε όλες τις νησίδες η καταμέτρηση των core hours γίνεται σε επίπεδο CPU.

Δείτε το πλήρες κείμενο της προκήρυξης για έργα προετοιμασίας και ανάπτυξης:
https://hpc.grnet.gr/access/preparatory-access

Για περισσότερες πληροφορίες ή διευκρινίσεις επικοινωνήστε μαζί μας στο hpc-access@grnet.gr

Ανοιχτή πρόσκληση υποβολής προτάσεων για πρόσβαση στην υποδομή PRACE

Στα πλαίσια του προγράμματος PRACE-1IP λειτουργεί συνεχόμενη ανοιχτή πρόσκληση (τύπου C), μέσω της οποίας δίνεται πρόσβαση στην Ευρωπαϊκή υπερυπολογιστική υποδομή επιπέδου Tier-0, για τη μεταφορά και εκτέλεση επιστημονικών εφαρμογών/μοντέλων.

Η υποδομή Tier-0 αποτελείται από τις υπερυπολογιστικές συστοιχίες:

  • Jugene (IBM Blue Gene/P) στο Jülich της Γερμανίας και
  • Curie (Bullx x86_64 cluster) στο Κέντρο ερευνών CEA στη Γαλλία.

Η πρόσκληση τύπου C αφορά στην ανάπτυξη κώδικα με την υποστήριξη από ειδικούς του PRACE και μέσω αυτής προσφέρονται εώς και 250.000 core hours στο Jugene και έως 200.000 core hours στο Curie ανά project.

Η συγκεκριμένη πρόσκληση αποσκοπεί στη δοκιμή και ανάπτυξη κώδικα για τη προετοιμασία εφαρμογών και όχι στην εκτέλεση εφαρμογών σε επίπεδο παραγωγής (production runs). Για την αξιολόγηση των προτάσεων είναι απαραίτητη αναλυτική περιγραφή των σημείων συμφόρησης (bottlenecks) του κάθε κώδικα καθώς επίσης και το προτεινόμενο πλάνο εργασίας.

Εφόσον ενδιαφέρεστε μπορείτε να επικοινωνήσετε με το KEEY Α.Π.Θ. για περισσότερες πληροφορίες.

Εντυπώσεις από το EGI User Forum 2011

Την προηγούμενη εβδομάδα διεξήχθει στο Vilnius της Λιθουανίας το EGI User Forum παράλληλα με το EMI Technical Forum. Το EGI (European Grid Infrastructure) είναι η αρχή διαχείρισης της πανευρωπαϊκής υπολογιστικής και αποθηκευτικής υποδομής ενώ το EMI (European Middleware Initiave) είναι η αρχή ανάπτυξης του μεσολογισμικού για τη χρήση κατανεμημένων υποδομών τύπου Grid, Cloud και HPC στην Ευρώπη. Το συνέδριο έδωσε τη δυνατότητα σε Ευρωπαίους ερευνητές να μοιραστούν την εμπειρία τους από τη χρήση κατανεμημένων υποδομών, να δημοσιεύσουν τα αποτελέσματα της έρευνάς τους και να ενημερωθούν για τις τελευταίες εξελίξεις σε θέματα υπολογιστικών υποδομών, κυρίως τύπων Grid και Cloud, και του ενδιάμεσου μεσολογισμικού.

Σε σχέση με το τελευταίο η κοινότητα αναμένει με ανυπομονησία τo EMI-1.0 release που θα περιλαμβάνει υπάρχοντα και νέα εργαλεία για την υποβολή και διαχείριση εργασιών και για τη διαχείριση δεδομένων σε κατανεμημένους αποθηκευτικούς πόρους. Η φιλοδοξία και η προοπτική που δίνει το ίδιο το EMI είναι ότι η αναμενόμενη έκδοση 1.0 θα μπορεί να εφαρμοστεί παράλληλα σε Grid, Cloud και HPC υποδομές έτσι ώστε οι χρήστες να έχουν τη δυνατότητα ανάλογα με τα δικαιώματα πρόσβασης που διαθέτουν στις διάφορες υποδομές απο ένα εννιαίο περιβάλλον να μπορούν να διαχειρίζονται εργασίες και δεδομένα ανεξάρτητα από το άν αυτά βρίσκονται σε Grid, Cloud ή πιο “κλασσικές” HPC πλατφόρμες.

Η ομάδα του Κέντρου Επιστημονικών Υπολογιστικών Υπηρεσιών παρουσίασε στα πλαίσια του EGI User Forum το morph, ένα νέο εργαλείο που αναπτύσσει για την υποβολή παραμετρικών εργασιών. Χρησιμοποιώντας το morph έναντι των εργαλείων του gLite για την υποβολή παραμετρικών εργασιών οι επι μέρους εργασίες που αποτυνχάνουν επαναυποβάλλονται αυτομάτως προς εκτέλεση χωρίς ο χρήστης να χρειάζεται να τις ξεχωρίσει μία προς μία και να τις υποβάλλει εκ νέου. Η χρήση της υπηρεσίας morph για την υποβολή παραμετρικών εργασιών αποτελεί λοιπόν έναν εγγυημένο τρόπο ώστε όλες οι επιμέρους παραμετρικές εργασίες να ολοκληρωθούν επιτυχώς. Περισσότερες λεπτομέρειες σχετικά με την υπηρεσία, που βρίσκεται στο στάδιο της ανάπτυξης, μπορούν οι ενδιαφερόμενοι να βρουν εδώ.

Σχολείο κατάρτισης σε HPC εργαλεία και τεχνικές

Στις 29-31 Μαρτίου πρόκειται να πραγματοποιηθεί στο Εδιμβούργο της Σκωτίας το DEISA/PRACE Spring School. Στα πλαίσια του σχολείου θα αναπτυχθούν και θα παρουσιαστούν θέματα HPC (High Performance Computing) όπως εργαλεία και τεχνικές προγραμματισμού για τη καλύτερη δυνατή κλιμάκωση εφαρμογών σε υπερυπολογιστικές υποδομές.

Το πρόγραμμα του σχολείου έχει ήδη αναρτηθεί ενώ όσοι ενδιαφέρονται μπορούν να συμπληρώσουν τη φόρμα αίτησης συμμετοχής εδώ.

Παράλληλα σας ενημερώνουμε ότι στα πλαίσια του έργου DEISA πρόκειται να καλυφθούν έξοδα έως 750 ευρώ για νέους ερευνητές που εργάζονται στην Ελλάδα και δραστηριοποιούνται στο χώρο της παραλληλίας εφαρμογών για υπολογιστές υψηλών επιδόσεων. Οι ενδιαφερόμενοι καλούνται το αργότερο στις 14 Φεβρουαρίου να αποστείλουν ένα σύντομο βιογραφικό, μία περιγραφή του ερευνητικού τους αντικειμένου και μία σύντομη αιτιολόγηση της επιθυμίας τους να παρακολουθήσουν το Spring School (εν είδει letter of intent).